Pada tahun 2040, Program Magister Pendidikan Agama Islam (PAI) bertujuan untuk menghasilkan sumber daya manusia unggul di bidang penyebaran Inovasi Pendidikan Islam, yang berdaya saing global dan berlandaskan pada nilai-nilai Islam serta nasionalisme Indonesia.
- Menyelenggarakan kegiatan pendidikan, penelitian, dan pengabdian kepada masyarakat (Tri Dharma Perguruan Tinggi) yang berkualitas tinggi dalam Program Magister PAI, berkontribusi pada pengembangan kesejahteraan nasional dan peradaban global yang berlandaskan nilai-nilai Islam dan nasionalisme Indonesia.
- Mengembangkan sistem dan suasana akademik yang kondusif dalam Program Magister PAI untuk mewujudkan budaya berkualitas dalam penerapan Tri Dharma Perguruan Tinggi melalui pengembangan tata kelola universitas yang baik secara bertahap dan berkelanjutan.
- Menghasilkan lulusan yang merupakan calon pendidik, peneliti, dan konsultan dalam PAI yang unggul dalam penyebaran inovasi pembelajaran PAI, kompeten, profesional, berakhlak mulia, serta berdaya saing global dengan menjunjung tinggi nilai-nilai Islam dan nasionalisme Indonesia.
- Menghasilkan lulusan yang mampu menghasilkan karya ilmiah bereputasi nasional dan internasional yang berkontribusi pada kemajuan intelektual bangsa.
- Mengembangkan sistem manajemen program yang berbasis pada prinsip-prinsip tata kelola universitas yang baik.
